Ciljano liječenje onkoloških bolesti
GENSKO PROFILIRANJE TUMORA
Gensko profiliranje tumora (NGS): Svaki tumor ima vlastite molekularne karakteristike. Genskim profiliranjem tumora moguće je analizirati promjene u tumorskim stanicama koje mogu biti važne za odabir liječenja.
NGS (Next Generation Sequencing) omogućuje istodobnu analizu velikog broja gena iz jednog uzorka tumora. Ovisno o vrsti analize, moguće je otkriti mutacije i druge molekularne promjene te biomarkere koji mogu ukazati na mogućnost primjene ciljane terapije, imunoterapije ili drugih oblika personaliziranog liječenja.
U Poliklinici Anova dostupni su različiti testovi za gensko profiliranje tumora – od panela usmjerenih na određene vrste raka do opsežnih analiza koje ispituju velik broj potencijalno važnih promjena.
Dobiveni nalaz ne promatramo izolirano. Onkolog ga interpretira u kontekstu vrste tumora, proširenosti bolesti, prethodnog liječenja i drugih karakteristika bolesti kako bi se procijenilo može li rezultat otvoriti dodatne mogućnosti liječenja.
Što je gensko profiliranje tumora?
Tumorske stanice tijekom nastanka i razvoja bolesti nakupljaju različite promjene u svojim genima. Neke od tih promjena mogu biti važne za rast tumora, ali istodobno mogu predstavljati i potencijalnu metu za određene lijekove.
Gensko profiliranje tumora analizira upravo takve promjene u tumorskim stanicama. Primjenom NGS tehnologije moguće je u jednoj analizi ispitati velik broj gena i tako dobiti detaljniji molekularni profil tumora. Dobiveni rezultat može pomoći u pronalaženju biomarkera važnih za odabir ciljane terapije, imunoterapije ili drugih mogućnosti liječenja.
Važno je razlikovati gensko profiliranje tumora od testiranja nasljedne sklonosti raku. Kod profiliranja tumora prvenstveno tražimo promjene koje su nastale u tumorskim stanicama tijekom razvoja bolesti. Nasljednim genetskim testiranjem, s druge strane, tražimo promjene prisutne od rođenja koje mogu povećavati rizik razvoja određenih vrsta raka i mogu se prenositi unutar obitelji.
Kada razmotriti gensko profiliranje tumora?
Gensko profiliranje tumora može biti korisno kada želimo detaljnije istražiti molekularne karakteristike tumora i provjeriti postoje li promjene koje bi mogle utjecati na izbor liječenja.
Najčešće se razmatra kod bolesnika s uznapredovalom ili metastatskom malignom bolešću, osobito kada su standardne mogućnosti liječenja ograničene ili iscrpljene. Može biti korisno i ranije ako za određenu vrstu tumora postoje poznate molekularne promjene koje mogu utjecati na izbor terapije.
Šire gensko profiliranje posebno može imati smisla kada:
-
postoji više mogućih molekularnih meta koje nije praktično analizirati pojedinačnim testovima
-
tumor je rijedak ili nema jasno definirane standardne mogućnosti liječenja
-
bolest napreduje nakon prethodno provedenih linija terapije
-
traže se dodatne mogućnosti ciljane terapije ili imunoterapije
-
razmatra se mogućnost uključivanja u kliničko ispitivanje na temelju molekularnih karakteristika tumora.
Gensko profiliranje nije jednako korisno za svakog bolesnika niti pronalazak genske promjene automatski znači da za nju postoji odgovarajuća terapija. Zato odluku o opsegu testiranja i značenje dobivenog nalaza treba procijeniti u kontekstu konkretne maligne bolesti i dosadašnjeg liječenja.
Što se genskim profiliranjem može otkriti?
Gensko profiliranje tumora ne traži samo jednu unaprijed određenu mutaciju. Ovisno o odabranom NGS panelu, istodobno se mogu analizirati različite vrste molekularnih promjena u tumorskim stanicama.
Analiza može obuhvatiti:
-
genske mutacije – promjene u slijedu DNA koje mogu utjecati na ponašanje tumora
-
amplifikacije i druge promjene broja kopija gena (CNV) – povećanje ili smanjenje broja kopija određenog gena
-
genske fuzije i druge strukturne promjene – spajanje dijelova različitih gena koje kod nekih tumora može predstavljati važnu terapijsku metu
-
mikrosatelitnu nestabilnost (MSI) i tumorsko mutacijsko opterećenje (TMB) kod panela koji uključuju ove biomarkere.
Širi paneli mogu analizirati nekoliko stotina gena istodobno. Primjerice, među dostupnim analizama nalazi se i panel koji obuhvaća više od 600 gena te analizira različite vrste promjena u DNA i RNA, uključujući mutacije, insercije i delecije, promjene broja kopija, genske fuzije, MSI i TMB.
Cilj takve analize nije samo opisati tumor na molekularnoj razini, već prvenstveno utvrditi postoje li klinički značajni biomarkeri koji mogu imati utjecaj na izbor liječenja.
Kako se radi gensko profiliranje tumora?
Gensko profiliranje najčešće se radi iz tumorskog tkiva, odnosno iz uzorka koji je već ranije uzet biopsijom ili operacijom. Kada je odgovarajuće tumorsko tkivo dostupno, analiza iz tkiva u pravilu je preferirani pristup jer omogućuje izravnu analizu molekularnih promjena u tumorskim stanicama.
U određenim situacijama gensko profiliranje moguće je napraviti i iz krvi (tekuća biopsija). Tada se analiziraju fragmenti tumorske DNA koji cirkuliraju u krvi. Ova mogućnost posebno je korisna kada tumorsko tkivo nije dostupno, nije ga moguće ponovno uzeti ili postoji drugi razlog zbog kojeg analiza tkiva nije praktična.
U Poliklinici Anova koristimo opsežne NGS analize koje u pravilu obuhvaćaju više od 600 gena, čime se istodobno može analizirati velik broj potencijalno važnih molekularnih promjena.
Odabir odgovarajućeg testa i vrste uzorka ovisi o vrsti tumora, dostupnom materijalu, prethodnom liječenju i kliničkom pitanju na koje želimo dobiti odgovor..
Što nakon dobivenog nalaza?
Nalaz genskog profiliranja može sadržavati velik broj molekularnih promjena, ali nisu sve jednako važne za liječenje. Ključno je procijeniti koje su promjene klinički značajne i postoji li terapija koja bi kod konkretnog bolesnika mogla imati smisla.
U Poliklinici Anova nalaz interpretira onkolog u kontekstu vrste i proširenosti tumora, prethodno provedenog liječenja i općeg stanja bolesnika. Na temelju rezultata možemo procijeniti postoje li dodatne mogućnosti liječenja, uključujući ciljanu terapiju, imunoterapiju ili potencijalno uključivanje u klinička ispitivanja.
Ponekad se pronađe promjena za koju postoji jasno definirana terapijska mogućnost, dok u drugim slučajevima pronađene promjene nemaju neposrednu terapijsku primjenu. Zbog toga je stručna interpretacija nalaza jednako važna kao i samo testiranje.
Česta pitanja o genskom profiliranju tumora
Iz kojeg se uzorka radi gensko profiliranje?
Preferirani uzorak je tumorsko tkivo, najčešće materijal dobiven tijekom ranije biopsije ili operacije. U određenim situacijama analiza se može napraviti i iz krvi, odnosno tekućom biopsijom.
Trebam li novu biopsiju za NGS testiranje?
Ne nužno. Ako postoji odgovarajući uzorak tumorskog tkiva od ranije biopsije ili operacije, često se može iskoristiti postojeći materijal. Prije testiranja potrebno je provjeriti postoji li odgovarajući uzorak i je li njegova kvaliteta dovoljna za planiranu analizu.
Koliko gena se analizira?
U Poliklinici Anova koristimo opsežne NGS analize koje u pravilu obuhvaćaju više od 600 gena. Odabir konkretnog panela ovisi o vrsti tumora, dostupnom uzorku i cilju testiranja.
Znači li pronađena mutacija da postoji odgovarajuća terapija?
Ne nužno. Neke pronađene promjene mogu imati jasno terapijsko značenje, dok za druge trenutačno ne postoji odgovarajuća terapija ili dostupni podaci nisu dovoljni za njezinu primjenu. Zato nalaz treba interpretirati u kontekstu konkretnog bolesnika i njegove bolesti.
Je li gensko profiliranje isto što i testiranje nasljedne sklonosti raku?
Nije. Gensko profiliranje prvenstveno analizira promjene prisutne u tumorskim stanicama, dok se genetskim testiranjem nasljedne sklonosti raku traže nasljedne promjene koje mogu povećati rizik razvoja malignih bolesti.
→ Više o genetskom testiranju i nasljednoj sklonosti raku
Kako mogu napraviti gensko profiliranje tumora?
Možete nam poslati upit zajedno s osnovnim podacima o dijagnozi i dostupnom medicinskom dokumentacijom. Na temelju vrste tumora, prethodnog liječenja i dostupnog uzorka možemo procijeniti koja bi analiza bila najprimjerenija te organizirati testiranje i interpretaciju dobivenog nalaza.
Medicinski tim
dr.sc. Davor Kust, dr.med. - specijalist onkologije i radioterapije
Anela Zorlak, mag.gen. - magistrica genetike
